بر اساس گزارش رسانه‌های ایرانی، ایران تمامی زندانیان زندان بدنام اوین را، که هزاران مجرم عادی، زندانی سیاسی و تعداد نامعلومی از اتباع خارجی و دوتابعیتی را در خود جای داده است، پس از حمله اسرائیل به این تأسیسات در روز دوشنبه، منتقل کرده است.
قوه قضائیه ایران روز سه‌شنبه اعلام کرد که تعدادی نامشخص از افراد، از جمله کارکنان زندان و بازدیدکنندگان، در این حمله زخمی شده و برخی دیگر جان باخته‌اند. اصغر جهانگیر، سخنگوی قوه قضائیه، بدون ارائه هیچ آماری گفت: "در این حادثه، ما شهید نیز داشتیم."
خبرگزاری مهر گزارش داد که سازمان زندان‌های ایران اعلام کرده است که زندانیان به دو زندان ناشناس در استان تهران منتقل شده‌اند و زندانیان با خانواده‌های خود تماس گرفته‌اند تا آنها را از محل جدید خود مطلع سازند. این عملیات در حالی آغاز شد که اسرائیل ایران را به نقض آتش‌بسی متهم کرد که رئیس‌جمهور دونالد ترامپ دوشنبه شب اعلام کرده بود. ترامپ گفته بود جنگ ۲۴ ساعت پس از آتش‌بس "پایان خواهد یافت".
ارتش اسرائیل اعلام کرد که ایران پس از اجرایی شدن آتش‌بس، دو موشک بالستیک به سمت اسرائیل شلیک کرده است. اسرائیل کاتز، وزیر دفاع، گفت که به نیروهای این کشور دستور داده است تا "قاطعانه پاسخ دهند". ایران نقض توافق آتش‌بس را تکذیب می‌کند.
ترامپ صبح سه‌شنبه با استفاده از ادبیاتی تند در شبکه تروث سوشال، هر دو طرف را مسئول فروپاشی آتش‌بس دانست و خشم خود را ابراز کرد. ترامپ اضافه کرد که اسرائیل قصد حمله به ایران را ندارد، ظاهراً در پاسخ به اعتراضات خودش.
ترامپ نوشت: "همه هواپیماها بازخواهند گشت و به خانه می‌روند، در حالی که به ایران 'سلامی دوستانه' می‌کنند. کسی آسیب نخواهد دید، آتش‌بس برقرار است."
اخبار اولیه انفجار در نزدیکی دروازه‌های اوین حدود ساعت ۱:۳۰ بعدازظهر به وقت محلی منتشر شد. کمی پس از آن، گیدئون ساعر، وزیر امور خارجه اسرائیل، ویدئویی را منتشر کرد که نشان می‌داد یک در زندان مورد اصابت موشک قرار گرفته است. رسانه‌های ایرانی گفتند که این حمله به دفتر دادستان و دو دادگاه معروف برای محاکمه مخالفان سیاسی در مجموعه اوین آسیب رسانده و پنجره‌های بخش شمالی آن را شکسته است. گزارش‌هایی مبنی بر آسیب‌دیدگی بیمارستان و بند زنان زندان نیز وجود داشت. با این حال، جزئیات همچنان مبهم است، زیرا رژیم هیچ اطلاعاتی در مورد تأثیرات کامل حمله اسرائیل ارائه نکرده است.
ژان نوئل باروت، وزیر امور خارجه فرانسه، در پستی در ایکس اقدام اسرائیل را "غیرقابل قبول" خواند و گفت که این اقدام جان دو شهروند فرانسوی، سسیل کولر و ژاک پاری، را که سه سال گذشته در اوین بازداشت بوده‌اند، به خطر انداخته است.
زندانیانی که با خانواده‌های خود تماس گرفتند، خشم خود را از رژیم ایران به دلیل نگه داشتن آنها در زندان پس از حمله اسرائیل ابراز کردند. ابوالفضل غیانی، منتقد برجسته رژیم که در اوین نگهداری می‌شد، تأثیر حمله را برای پسرش شرح داد و پسرش این توضیحات را در ایکس منتشر کرد: "همه پنجره‌ها شکسته‌اند و بیمارستان زندان تا حدی آسیب دیده است. آیا جمهوری اسلامی قصد دارد همه این زندانیان سیاسی را در بازداشت نگه دارد؟ بسیاری از آنها بیمار هستند، این چه جنون و رذالتی است؟"
برخی حدس می‌زنند که هدف اسرائیل از حمله به اوین، تشویق زندانیان به شورش و فرار بوده است، در حالی که برخی دیگر انگیزه‌های متفاوتی را درک کردند.
ولی نصر، دانشگاهی ایرانی-آمریکایی و نویسنده کتاب تازه منتشر شده "استراتژی بزرگ ایران"، به المانیتور گفت: "فکر می‌کنم حمله به اوین عمدتاً نمایشی بود، تا بگویند اسرائیل از اپوزیسیون ایران در برابر استبداد حمایت می‌کند. این یک عملیات روانی است."
نازنین زاغری-رتکلیف، شهروند دوتابعیتی بریتانیایی-ایرانی که پنج سال در اوین زندانی بود تا اینکه با معامله‌ای چند میلیون دلاری آزاد شد، حمله اسرائیل را یک حرکت تبلیغاتی خواند که جان زندانیان را به خطر انداخته و خطر سرکوب ایران علیه غیرنظامیان را افزایش داده است.
رتکلیف روز سه‌شنبه در مقاله‌ای برای گاردین نوشت که میلیون‌ها نفر از ساکنان تهران "بین بمب و موقعیتی دشوار گیر افتاده‌اند" و تجربه او در زندان به او آموخته است که "آزادی از بمب‌ها و خشونت‌ها نمی‌آید، و نه از کارهای زیرکانه برای دوربین‌ها، بلکه از ارتباط انسانی و همدلی می‌آید."
رتکلیف اضافه کرد: "این حمله به برخی زندانیان آسیب رساند، برخی را ناپدید و منتقل کرد. بسیاری از خانواده‌ها اکنون به شدت نگران هستند."