جاسوسان اسرائیلی به قلب برنامه‌های موشکی و هسته‌ای ایران نفوذ کرده و سال‌ها به جمع‌آوری اطلاعات محرمانه پرداختند و ارزیابی کردند که زیرساخت‌های ساخت سلاح تهران بسیار گسترده‌تر از آنچه قبلاً تصور می‌شد است.
اسناد اطلاعاتی فاش شده که با متحدان غربی از جمله ایالات متحده و بریتانیا به اشتراک گذاشته شده و توسط تایمز مشاهده شده‌اند، به نظر می‌رسد که گستره کامل جاه‌طلبی‌های هسته‌ای و موشکی ایران را فاش می‌کنند. نتیجه‌گیری سازمان جاسوسی اسرائیل، موساد، و همچنین سایر نهادهای اطلاعاتی نظامی این بود که توانمندی، دانش و اجزای توسعه رژیم با سرعت پیش می‌رفت و بسیار گسترده‌تر از تنها سایت‌های اصلی فردو، نطنز و اصفهان بود.
یک منبع اطلاعاتی روز جمعه به تایمز گفت که اسرائیل سال‌ها از طریق عوامل اطلاعاتی خود چندین مکان را زیر نظر داشته است و هر مکان «از قبل نیروهای میدانی» داشته است. اسرائیل بر اساس اطلاعاتی در مورد برنامه تسلیحاتی شتاب‌گرفته ایران، از اوایل سال ۲۰۱۰ شروع به آماده‌سازی حمله خود به ایران کرده بود.
این اسناد در بحبوحه گزارش‌های متناقض درباره خسارات وارده به سایت‌های هسته‌ای پس از جنگ ۱۲ روزه فاش شد. در حالی که پرزیدنت ترامپ گفته بود سایت فردو توسط بمب‌های موسوم به «پناهگاه‌شکن» نابود شده است، برخی کارشناسان معتقدند که ذخایر باقی‌مانده اورانیوم غنی‌شده و سانتریفیوژهای تولید شده ممکن است همچنان قادر به تولید سلاح هسته‌ای در آینده باشند. آمریکا همچنین حملاتی را به سایت‌های هسته‌ای نطنز و اصفهان انجام داد.
عملیات نظامی اسرائیل بر اساس اطلاعاتی بود که تولید سانتریفیوژها، ابزارهایی برای غنی‌سازی اورانیوم، را در سه سایت در تهران و اصفهان شناسایی کرده بود. تمامی این سایت‌ها در جریان درگیری توسط اسرائیل مورد حمله قرار گرفته و منهدم شدند.
حملات همچنین بر هفت بخش مجزا در تاسیسات نطنز، سایت اصلی غنی‌سازی ایران، متمرکز بودند. افسران اطلاعاتی از جاسوسان میدانی برای نقشه‌برداری از چیدمان نطنز استفاده کردند و ساختمان‌های روی زمین و زیرزمینی را که شامل لوله‌کشی، تغذیه و جامدسازی اورانیوم بودند، شناسایی کردند. اسرائیل همچنین به زیرساخت‌های برق، یک ساختمان تحقیق و توسعه، ایستگاه ترانسفورماتور و ساختار ژنراتور پشتیبانی‌کننده شبکه برق حمله کرد. این حمله همچنین کانال‌های تهویه و خنک‌کننده را مورد هدف قرار داد.
علاوه بر نطنز، شناسایی اسرائیل به یک تاسیسات در اصفهان، سایت‌های نور و مقده برای محاسبات و آزمایشگاه‌ها، سایت نظامی شریعتی و آشیانه بزرگ در شهید میثمی که مواد منفجره پلاستیکی مورد استفاده برای آزمایش سلاح‌های هسته‌ای و همچنین سایر مواد و مواد شیمیایی پیشرفته را تولید می‌کرد، نفوذ، حمله و تخریب کرد. بسیاری از این سایت‌ها توسط سازمان پژوهش و نوآوری‌های دفاعی (سپند) که یک سازمان مادر تحت رهبری محسن فخری‌زاده، فیزیکدان هسته‌ای ایرانی بود، تاسیس شده بودند؛ فخری‌زاده در سال ۲۰۲۰ با یک مسلسل کنترل‌شده ماهواره‌ای ترور شد – گفته می‌شود توسط اسرائیل.
این اسناد همچنین به نفوذ به مقر سپاه پاسداران انقلاب اسلامی (IRGC) که در روزهای پایانی جنگ مورد حمله قرار گرفت، و به سایت‌های هسته‌ای مانند سنجریان، که طبق گفته اسرائیل، اجزای دخیل در ایجاد سلاح‌های هسته‌ای را توسعه می‌داد، اشاره داشتند. بر اساس این گزارش، ایران تا پایان سال ۲۰۲۴ از مرحله تحقیق تسلیحاتی به ایجاد یک سیستم انفجاری و تابشی پیشرفته، اجرای آزمایشات و دستیابی به قابلیت هسته‌ای «در عرض چند هفته» حرکت کرده بود.
مقیاس و جزئیات این ارزیابی به سال‌ها جمع‌آوری اطلاعات اشاره دارد که ممکن است همچنان ادامه داشته باشد. ترامپ در اجلاس ناتو در لاهه به خبرنگاران گفت: «می‌دانید که آنها پس از حمله، افرادی را دارند که به آنجا می‌روند، و آنها گفتند که تخریب کامل بود.» – این نشان می‌دهد که جاسوسان ممکن است هنوز در خاک ایران باقی مانده باشند.
عمق نفوذ اسرائیل در اوایل سال ۲۰۱۰، زمانی که یک دانشمند هسته‌ای ایرانی در روز روشن ترور شد، آشکار شد. از آن زمان چهار نفر دیگر نیز ترور شده‌اند. اما این موضوع اخیراً با ترور اسماعیل هنیه، رئیس سیاسی حماس، در جولای سال گذشته، زمانی که موساد عوامل امنیتی ایرانی را برای قرار دادن مواد منفجره در چندین اتاق یک مهمانسرا در تهران استخدام کرد، بیشتر مورد توجه قرار گرفت.
گفته می‌شود اطلاعات اسرائیل همچنین چند هفته پیش احتمال ترور رهبر معظم ایران، علی خامنه‌ای را مطرح کرده بود – چیزی که ترامپ به صراحت با آن مخالف بود.
ترامپ روز جمعه در پستی در شبکه اجتماعی Truth Social، به ادعاهای اخیر خامنه‌ای مبنی بر اینکه ایران «سیلی بزرگی» به آمریکا زده است، پاسخ داد و رهبر آمریکا گفت که وی رهبر معظم را از «مرگی بسیار زشت و ننگین» «نجات داده است».
ترامپ گفت: «چرا به اصطلاح «رهبر معظم»، آیت‌الله علی خامنه‌ای... اینقدر آشکارا و احمقانه می‌گوید که در جنگ با اسرائیل پیروز شده است، در حالی که می‌داند اظهاراتش دروغ است؟» وی افزود که به دلیل این اظهارات، کار بر روی لغو تحریم‌ها در مذاکرات با تهران را «متوقف» کرده است.
عباس عراقچی، وزیر امور خارجه ایران، در شبکه X پاسخ داد: «اگر پرزیدنت ترامپ در مورد تمایل به توافق هسته‌ای با ایران صادق است، باید لحن بی‌احترامی و غیرقابل قبول نسبت به رهبر معظم ایران را کنار بگذارد.»
اسناد اطلاعاتی که توسط تایمز مشاهده شده‌اند، نشان می‌دهند که ایران قصد داشت ده‌ها موشک دوربرد سطح به سطح در ماه تولید کند، که منجر به تولید تا ۱۰۰۰ موشک در سال با هدف گزارش‌شده ذخیره ۸۰۰۰ موشک می‌شد. کارشناسان تخمین می‌زنند که ایران جنگ را با حدود ۲۰۰۰ تا ۲۵۰۰ موشک بالستیک آغاز کرد.
به گفته یک منبع اطلاعاتی که در اسناد ذکر شده است، عوامل در ایران از هر کارگاه و کارخانه‌ای که بعداً مورد حمله قرار گرفتند بازدید کردند و این امر اسرائیل را قادر ساخت تا «کل صنعتی که از تولید مقادیر زیادی موشک حمایت می‌کرد»، را هدف قرار دهد. این منبع افزود که این سایت‌ها هم نظامی و هم غیرنظامی بودند.
یکی از این سایت‌ها، معهد ترکیبی نوید در رشت بود که در ساحل دریای خزر قرار داشت و تحت نظارت سازمان صنایع هوافضای ایران فعالیت می‌کرد. طبق اطلاعات اسرائیل، این مرکز تمام فیبر کربن مورد نیاز برای تولید موشک را تولید می‌کرد. این سایت نیز توسط بمب‌های اسرائیلی منهدم شد.
ده‌ها مکان و سایتی که در دو هفته گذشته مورد حمله قرار گرفتند، از جمله مجتمع نظامی پارچین در ۳۰ کیلومتری جنوب شرقی تهران، و همچنین سایت‌های هدایت، ناوبری و کنترل موشک‌ها و تولید کلاهک‌ها و موتورهای مورد نیاز برای پرواز موشک‌ها، یک سیستم تولید پیچیده را نشان می‌دهد که ده‌ها سال طول کشید تا ایجاد شود.
مقیاس نفوذ به رژیم ایران تنها باعث افزایش پارانویا در تهران شده است. در طول ۱۲ روز خصومت، ایران ده‌ها نفر را به ظن جاسوسی دستگیر کرد. تلاش‌ها برای شکار نفوذی‌ها پس از ترور هنیه آغاز شد، و اعضای سپاه پاسداران به یکدیگر در مورد نقض امنیت مشکوک شدند. این موضوع روز جمعه زمانی که موساد در پستی در X به ایرانیان هشدار داد که از مقامات سپاه پاسداران و وسایل نقلیه متعلق به رژیم دوری کنند، نشان داده شد.
روش‌های استخدام موساد، از جمله استخدام افراد نفوذی ایرانی، یک راز محافظت شده است، اما حتی به یک سریال هیجان‌انگیز جاسوسی محبوب، «تهران»، نیز منجر شده است. یکی از مشهورترین سرقت‌های موساد در ایران، ضبط آرشیوهای هسته‌ای ایران از یک گاوصندوق غول‌پیکر در سال ۲۰۱۸ بود. اسناد فوق محرمانه بعداً به عنوان مبنایی برای متقاعد کردن ترامپ برای خروج از توافق هسته‌ای سال ۲۰۱۵ مورد استفاده قرار گرفتند. در این توافق، ایران برنامه هسته‌ای خود را در ازای لغو تحریم‌ها محدود می‌کرد.
عراقچی، وزیر امور خارجه ایران، عصر پنجشنبه اذعان کرد که عملیات اسرائیل و آمریکا خسارت «بیش از حد و جدی» به تاسیسات هسته‌ای این کشور وارد کرده است، بدون اینکه جزئیات بیشتری ارائه دهد. عراقچی افزود که «هیچ توافقی» در مورد مذاکرات هسته‌ای آتی با واشنگتن حاصل نشده است.
دکتر افرات سوفر، تحلیلگر ایرانی-اسرائیلی و رئیس مرکز عزری برای تحقیقات ایران و کشورهای حوزه خلیج فارس در دانشگاه حیفا انگلستان گفت: «اسرائیل دهه‌هاست که فعالیت‌های داخل ایران را زیر نظر دارد.»
«موساد نقش محوری در موفقیت در خنثی کردن تهدید ایران ایفا کرده است، و عملیات‌های موفقیت‌آمیز آن در قبال ایران و نیروهای نیابتی آن در کتاب‌های تاریخ ثبت خواهد شد.»